カスタムリンクを別ウィンドウで開く方法が分からず、遷移していまう設定でした。調べてみると、表示オプションで表示できるようにすればできることが分かりました。
表示オプションの変更
外観→メニューよりメニュー画面を表示させます。
画面右上の「表示オプション」をクリックします。
上に詳細メニュー設定を表示の中に「リンクターゲット」をチェックし、メニューを保存します。
カスタムリンクの変更
カスタムリンクを開き、「リンクを新しいタブで開く」にチェックを入れて保存します。
これで、別ウィンドウでリンクが開くようになり、遷移せず自分のホームページは維持されます。